同济大学现代农业科学与工程研究院成立于2000年，研究院融合我校建筑、规划、能源、环境、自动控制、机械、材料、应用化学、生命、经济与管理等多学科综合优势，打造一个新兴的、具有多学科交叉特色的现代农业科学与工程集成技术和复合型人才培养的基地。

下设院办公室、设施农业技术研究所，生态园区与景观规划研究所、农副产品安全及深加工研究所、农业环境工程研究所、农业信息技术研究所。

现代农业科学与工程研究院是由学校多个优势学科交叉组成的现代农业学科平台，“国产化智能温室及其环境控制系统等配套设施的研制”项目2005年获教育部科技进步一等奖、2007年获国家科技进步二等奖。我院与上海都市绿色工程有限公司联合申报的“国家设施农业工程技术研究中心”2011年1月正式获科技部批准立项建设，该国家工程技术研究中心与“教育部设施农业网上合作研究中心”、“上海市设施农业工程技术研究中心”均挂靠我院。

结合国家设施农业工程技术研究中心和其它两个中心的建设，围绕学校建设目标，以可持续发展为切入点，更好地融入到学校学科发展中去，进一步强化以“多学科、综合性、工程化”为特色的同济大学农业学科建设。

我院重点开展农业环境与生态景观、农业信息与控制、生物质能源、农业生物生理与生产技术四方面的学科建设和研究工作。